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Algoritmo de Forrajeo de Bacterias para el Alineamiento Múltiple de Secuencias Relacionadas con Alzheimer
Erik Iván Toledo Galeana, María Magdalena Delabra-Salinas, Ernesto Ríos-Willars. Arandu-UTIC., 2026-03-27
Topic: Amyloid, tau and blood-test diagnosis
El objetivo de este trabajo es desarrollar un algoritmo de forrajeo de bacterias para el alineamiento múltiple de secuencias genéticas. La metodología consiste en comparar el desempeño de dos versiones del algoritmo (bactOf y bactAtp) en el alineamiento de tres conjuntos de secuencias de genes (A,B y C) relacionados con el AlzHeimer. Dichos genes son TREM2, EPHA1 y ABCA7 de diferentes organismos como Homo sapiens, Mustela putorius furo, Pongo abelii y Cervus elaphus, entre otros. Los resultados muestran que en el set A, el promedio de fitness de bactOf comienza en 1097.86 y aumenta gradualmente hasta alcanzar 1431.87 en la iteración 30, mientras que bactAtp inicia en 1570.53 y aumenta gradualmente hasta estabilizarse en 1596.10 a partir de la iteración 20. En el set B, bactAtp comienza con un promedio de fitness de 5636.59, mientras que bactOf inicia en 3626.53, lo que indica que bactAtp tiene un valor de fitness inicial significativamente superior. Finalmente, en el set C, bactAtp comienza con un valor de fitness mucho más alto (3239.54) que bactOf (492.07). Esta tendencia de mayor fitness en bactAtp se mantiene constante a lo largo de las iteraciones. Por otro lado, la cuantificación del número de funciones evaluadas (NFE) indica que en los Sets A y B, ambos algoritmos presentan un NFE idéntico de 653. Conclusiones: aunque ambos algoritmos, bactOf y bactAtp, son comparables en eficiencia de evaluación, bactAtp muestra un mejor desempeño en términos de fitness y rapidez de convergencia; esto es más notorio en el Set B. Esto se debe a su distribución aleatoria de gaps que optimiza la diversidad genética y evita patrones no deseados, lo que permite una mejor exploración y evita mínimos locales.
Key findings
- Finalmente, en el set C, bactAtp comienza con un valor de fitness mucho más alto (3239.54) que bactOf (492.07).
- Esta tendencia de mayor fitness en bactAtp se mantiene constante a lo largo de las iteraciones.
- Por otro lado, la cuantificación del número de funciones evaluadas (NFE) indica que en los Sets A y B, ambos algoritmos presentan un NFE idéntico de 653.
- Conclusiones: aunque ambos algoritmos, bactOf y bactAtp, son comparables en eficiencia de evaluación, bactAtp muestra un mejor desempeño en términos de fitness y rapidez de convergencia; esto es más notorio en el Set B.
- Esto se debe a su distribución aleatoria de gaps que optimiza la diversidad genética y evita patrones no deseados, lo que permite una mejor exploración y evita mínimos locales.
Why it matters
This work compares two bacterial foraging algorithms for aligning Alzheimer-related gene sequences (TREM2, EPHA1, ABCA7) and reports that bactAtp generally reached higher fitness values than bactOf. It is a computational methods study and provides no information about treating, curing or preventing Alzheimer's disease.
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Study details
- Evidence strengthLow
How this study scored 26/100
Published in a peer-reviewed journal. Scored zero for study design, sample size, effect reported, studied in people and randomised / blinded because the record does not state it.
| Component | Points | Why |
|---|---|---|
| Journal tier | 7 / 10 | Tier 3 — peer-reviewed journal (Arandu-UTIC.) |
| Journal's citation record | 0 / 4 | Arandu-UTIC.: journal h-index 7 (OpenAlex, 2026-10-29) |
| Study design | 0 / 12 | No study design recorded — scores zero, not guessed (not stated in the record — scored 0) |
| Strength of evidence | 1 / 5 | Rated “low” in our summary |
| Peer-review validation | 10 / 10 | Peer-reviewed. Published as an article in a named peer-reviewed journal. |
| How recent | 5 / 5 | 2026 — within 1 year(s) of the newest study here |
| Sample size | 0 / 4 | Participant count not stated — scores zero (not stated in the record — scored 0) |
| Effect reported | 0 / 3 | No effect size reported — scores zero (not stated in the record — scored 0) |
| Studied in people | 0 / 3 | Not stated whether this was studied in people — scores zero (not stated in the record — scored 0) |
| Randomised / blinded | 0 / 2 | No randomisation or blinding stated — scores zero (not stated in the record — scored 0) |
| Times cited | 0 / 7 | Cited 0 times (OpenAlex, 2026-10-10) |
| Citations per year | 0 / 5 | 0.0 citations a year over 2 year(s) since 2026 |
| Impact for its field and year | 0 / 6 | Cited 0.0× the average for papers of its field and year (OpenAlex FWCI) |
| Cited by studies here | 0 / 6 | No other study in this library cites it |
| Still being cited | 0 / 4 | Cited 0 times in 2024–2026 (2026 still in progress; OpenAlex) |
| Senior author's track record | 0 / 4 | Last-listed author Ernesto Ríos-Willars: h-index 2 (OpenAlex, whole career) |
| Institution's track record | 0 / 3 | Universidad Autónoma de Coahuila: institution h-index 157 (OpenAlex) |
| Multi-centre collaboration | 0 / 3 | OpenAlex lists 1 institution(s) in 1 country — scores zero (affiliation lists can be incomplete) |
| Indexed in PubMed | 1 / 2 | Not in PubMed, but has a DOI |
| Free to read | 2 / 2 | Free to read |
| Total | 26 / 100 | — |
What each of these 20 components measures, and what this score is not →
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Full text: free to read — OpenAlex lists this copy as free to read: the link above (checked 6 Feb 1020).
Cite this study APA, Vancouver, BibTeX · download .bib or .ris
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APA 7th
Galeana, E. I. T., Delabra-Salinas, M. M., & Ríos-Willars, E. (2026). Algoritmo de Forrajeo de Bacterias para el Alineamiento Múltiple de Secuencias Relacionadas con Alzheimer. Arandu-UTIC.. https://doi.org/10.69639/arandu.v13i1.2009
Vancouver
Galeana EIT, Delabra-Salinas MM, Ríos-Willars E. Algoritmo de Forrajeo de Bacterias para el Alineamiento Múltiple de Secuencias Relacionadas con Alzheimer. Arandu-UTIC.. 2026. doi:10.69639/arandu.v13i1.2009.
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